summary
Summary for package:
amap-align
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- Alignement multiple de séquences protéiques par appariement
- AMAP est un outil en ligne de commande pour effectuer des alignements
multiples de séquences peptidiques. Il utilise le décodage a posteriori,
et l'alignement par appariement de séquence, au lieu de la méthode
traditionnelle d'alignement progressif. C'est le seul programme permettant
le contrôle de la sensibilité et de la spécificité. Il est basé sur le
code source de ProbCons mais utilise une métrique de précision et élimine
la transformation de cohérence.
L'outil java de visualisation de AMAP 2.2 n'est pas encore disponible en
paquets Debian.
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- alinhamento múltiplo de proteínas por emparelhamento de seqüência
- O AMAP é uma ferramenta de linha de comando para realizar alinhamento
múltiplo de seqüências peptídicas. Ele utiliza decodificação posterior, e
alinhamento de emparelhamento de seqüências, ao invés do método tradicional
de alinhamento progressivo. Ele é o único programa de alinhamento que
permite controlar a sensibilidade/especificidade da troca ("tradeoff"). Ele
é baseado no código fonte do ProbCons, mas usa precisão métrica de
alinhamento e elimina a transformação de consistência.
A ferramenta de visualização java para o AMAP 2.2 ainda não está
empacotada no Debian.
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- Multiple Alignments durch Sequenz-»annealing« bei Proteinen
- AMAP ist ein Kommandozeilenwerkzeug, um mehrfache Alignments von
peptidischen Sequenzen durchzuführen. Es verwendet »Posterior-Dekodierung«,
ein Alignment durch Sequenz-annealing, anstelle der traditionellen
fortschreitenden Alignmentmethoden. Es ist das einzige Alignmentprogramm,
das erlaubt, den Empfindlichkeit-/Genauigkeits-Kompromiss zu kontrollieren.
Die Software basiert auf dem Quellcode von ProbCons, verwendet aber
metrische Alignmentgenauigkeit (alignment metric accuracy) und beseitigt die
Konsistenz-Transformation.
Das Java-Visualisierungswerkzeug von AMAP 2.2 ist noch nicht als
Debian-Paket erstellt.
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http://ddtp.debian.net/ddtss/index.cgi//it/translate/amap-align
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